Level

Master/Doctoral

Credits

04 (60 h)

Content:

Studies on molecular techniques used for detection and identification of plant diseases.  Information on DNA sequencing and basic bioinformatics for data analysis. Studies on Molecular Markers applied to phytopathology and on serological techniques for identifying pathogens.

Professor

Renata Faier Calegario

References

BRASILEIRO, A.C.M., CARNEIRO, V.T.de C. Manual de transformação genética de plantas. 2ª ed. Brasília: EMBRAPA, 2015. p.456

EIRAS, M.; GALLETI S.R. (Editores técnicos). Técnicas de diagnóstico de fitopatógenos. São Paulo: Devir, 2012.

HAMPTOM, R., BALL, E. & DE BOER, S. (Eds.). Serological methods for detection and identification of viral and bacterial plant pathogens – A Laboratory Manual. APS Press, St.

JANSSEN, T., KARSSEN, G., COUVREUR, M., WAEYENBERGE, L., BERT, W. The pitfalls of molecular species identification: a case study within the genus Pratylenchus (Nematoda:

Koressaar T, Lepamets M, Kaplinski L, Raime K, Andreson R and Remm M. Primer3_masker: integrating masking of template sequence with primer design software.

MALAJOVICH M. A. Biotecnologia 2011. Rio de Janeiro, Edições da Biblioteca Max Feffer do Instituto de Tecnologia ORT, 2012.

Malarczyk, D., Panek, J., Frac, M. Alternative Molecular-Based Diagnostic Methods of Plant Pathogenic Fungi Affecting Berry Crops-A Review. Molecules Molecules 2019, 24,

Martinelli, f.,   Scalenghe, r., Davino, s Panno, s., Scuderi, g., Ruisi, p., Villa, p., Stroppiana, d., Boschetti, m., Goulart, l.r., Davis, c.e., Dandekar, a.m. Advanced methods of plant

MORGANTE, C.V.; BLAWID, R. Análise da expressão gênica pela técnica de PCR quantitativa em tempo real: princípios e fundamentos. Petrolina: Embrapa Semiárido, Documentos, 278, 2016. 63 p. 

Nadeem, M.A., Nawaz, M.A., Shahid, M.Q., DoÄŸan, Y., Comertpay, G., Yıldız, M., HatipoÄŸlu, R., Ahmad, F.,  Alsaleh, A., Labhane, N., Özkan, H., Chung G., Baloch, F.S. DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing, Biotechnology & Biotechnological Equipment, 2018, 32:2, 261-285.

OLIVEIRA, E.M.M; de Oliveira, t.C.; de Souza, A.M.; dos Santos, T.F.; de Lima, I.S. Desenho de Primers Degenerados através de Bioinformática. Rio de Janeiro: Embrapa

QUISEN, R.C.; ÂNGELO, P.C.S. Manual de procedimentos do Laboratório de Cultura de Tecidos da Embrapa Amazônia Ocidental. Manaus: Embrapa Amazônia Ocidental. Documentos 61. 2008. 44p.

ROMANO, E.; BRASILEIRO, A.C.M. Extração de DNA de plantas. Biotecnologia, Ciência e Desenvolvimento, v. 2, n. 9, p. 40-43, 1999.

RUBIO, L.; GALIPIENSO, L.; FERRIOL, I. Detection of Plant Viruses and Disease Management: Relevance of Genetic Diversity and Evolution. Front. Plant Sci., 11, 2020. 

ZAHA, A., FERREIRA, H.B., PASSAGLIA, L.M.P. Biologia molecular básica [recurso eletrônico]. 5. ed. Dados eletrônicos. Porto Alegre: Artmed, 2014.